Время действия в эпоху Эдо. Есть люди - Мастера Муши, который расследуют странные случаи (н-р, мальчик рисуя левой рукой, может оживить рисунок; девушка, путешествующая вместе с озером(которое и есть муши); деревня оглохла на 1 ухо и тд). Эти мастера способны видеть муши (жуки - прямой перевод) и помогают людям. Главный персонаж Гинко-сан. В детстве у него погибла мать под обвалом. Так получилось, что он пришел в старую хижину в которой жила мастер муши Нуй (по моему так ее звали), у нее не было 1 глаза. Она потеряла всю свою семью - их поглотил Токоями (Тьма) и она осталась жить воз пруда, в котором и живет этот муши. В озере живет рыба Гинко, которая привлекает маленькго мальчика, но Нуй строго настрого запрещает туда ходить. В общем, ее тоже поглощает Токоями, а мальчик увязывается за ней, и что бы его спасти она закрывает ему правый глаз. Суть в том, что самое главное после этого не забыть свое имя, иначе все прошлое будет стерто из памяти. Когда он пришел в себя, то вспомнил лишь имя рыбы - Гинко,  а так же он поседел и лишился левого глаза) И теперь Гинко-сан не помнит прошлого, но путешествует по Японии, помогая обычным людям с их проблемами (естественно, все проблемы у них от муши)...
Ах да, его постоянно преследуют муши, по этому он постоянно курит и не может находиться в 1 месте долго)

вот хороший клип по Mushi-shi